Причиной гибели чаще становился не бой, а теснота, голод и болезни. Плавучие тюрьмы, в основном переоборудованные корабли, заполняли пленными, когда наземные британские тюрьмы Нью-Йорка переполнялись. На «Джерси», рассчитанной примерно на 400 моряков, держали до 1 200 человек; по свидетельству пленного Джона Блэтчфорда, многие были истощены, почти раздеты и покрыты вшами. Больных переводили на госпитальные суда, откуда, вспоминал он, почти никто не возвращался.
Точная цифра погибших неизвестна, но Национальная служба парков США приводит оценку свыше 11 500 человек за 1776–1783 годы; большинство, согласно архивным записям, умерло на одной «Джерси». Их останки хоронили на берегу, а позднее перенесли в крипту мемориала в Бруклине.